Juliane Da Graça
Lauréate 2025

Résumé du travail

L’autophagie est un processus cellulaire initié par la formation de novo d’une vésicule à double membrane appelée autophagosome, qui provient d’une structure transitoire nommée phagophore. La biogenèse du phagophore nécessite une transition de phase et se produit à proximité immédiate de sous-domaines du réticulum endoplasmique (RE), qui peuvent être engagés dans des points d’ancrage membranaires avec d’autres organelles telles que les mitochondries et la membrane plasmique. Récemment, nous avons démontré un recrutement dynamique des membranes endosomales précoces vers les sites de biogenèse du phagophore. Nos travaux actuels montrent que le nombre de sites de contact endosomes-RE (EERCS) augmente lors de la réponse aiguë à la privation nutritionnelle, et qu’ils sont mobilisés aux étapes précoces de la voie autophagique. Afin d’examiner de manière pertinente l’implication des EERCS dans la biogenèse du phagophore, nous avons optimisé différentes technologies de pointe spécifiques à l’étude des sites de contact (à savoir : la microscopie d’expansion, l’analyse basée sur l’apprentissage automatique, le split-turboID, et la purification biochimique). Des analyses plus poussées de la nature et de la dynamique des EERCS ont révélé leur implication dans la création d’un microenvironnement possédant des propriétés biochimiques spécifiques. Celles-ci incluent la transition de phase et la libération confinée de Ca²⁺, des événements susceptibles de favoriser la génération de membranes de novo. Nous identifions ici un rôle inédit pour les sites de contact membranaire entre le RE et les endosomes lors de la réponse précoce à la privation en nutriments. Nous proposons que la mobilisation dynamique des EERCS permette un confinement transitoire du cytoplasme, ce qui favorise l’enrichissement local en protéines, lipides et ions nécessaires à l’initiation de la biogenèse du phagophore.